会员大会是公会的最高权力机构。理事会是会员大会的执行机构，在会员大会闭会期间领导公会开展日常工作，对会员大会负责。理事会由三十九家会员理事单位组成。会员理事包括二十七家中资理事单位、十二家外资理事单位。中国工商银行上海市分行、中国农业银行上海市分行、中国银行上海市分行、中国建设银行上海市分行、交通银行上海市分行、上海浦东发展银行为当然理事单位。公会监事会由五名监事组成，包括3家中资监事单位、2家外资监事单位，设监事长一名。

      秘书处是公会的日常办事机构，协助理事会处理公会日常事务。秘书处设秘书长一名，常务副秘书长一名，副秘书长若干名。秘书处现设六个部门，包括办公室、自律规范部、协调维权部、教育培训部、会员服务部、综合管理部。

      公会下设专业委员会等专业机构，在公会理事会的领导下，根据公会章程和相关规定，分别在不同专业领域引领会员单位开展工作。公会现设25个专业委员会。